PXW-Z90に256GBのメモリーカードを2枚入れてリレー記録するよう設定して13時間記録しようとしましたが、2枚目のメモリーカードにリレーせず6時間で停止してしまいます。

1回の撮影での連続記録可能時間は、MPEG HD、XAVC(HD/QFHD)で約6時間、 AVCHDで約13時間です。
リレー記録の場合は、MPEG HD、XAVC(HD/QFHD)も約13時間記録可能です。
ただし、256GBのメモリーカードではリレー記録できませんので、128GBのメモリーカードをご利用ください。

256GBのメモリーカードを使用すると、XAVC HD 50Mで約8時間記録できる容量がありますが、このフォーマットの記録では、1クリップの連続記録可能時間である約6時間の制限により、リレー記録をすることなく停止してしまいます。
次のメモリーカードにリレーして記録するためには、メモリーカードの容量いっぱいまで記録する必要があります。
例えば、128GBのメモリーカードを使用すると1枚で約4時間記録でき、1クリップ約6時間の制限に達しないため、2枚目にリレーして記録されます。
このように正しくリレー記録がされると、メモリーカードの入れ替えは必要になりますが最長で約13時間の記録が可能です。