HVO-3300MTでCh1Ch2同時録画している時に、DVDにCh2の2Dのみを記録することはできますか。

HVO-3300MT本体と外部メディアへの記録は分けることができます。
外部メディアへの保存は[ユーザー設定]＞[外部保存 2]でチェックされたものが保存されるので、
［動画保存］の「Ch2 2D」のみにチェックを入れることで、外部メディアへの記録は「Ch2 2D」だけになります。